Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LumP51885 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LumP51885 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LumP51885 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LumP51885 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LumP51885 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LumP51885 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LumP51885 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LumP51885 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LumP51885 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LumP51885 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LumP51885 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LumP51885 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LumP51885 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LumP51885 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LumP51885 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LumP51885 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LumP51885 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LumP51885 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LumP51885 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LumP51885 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LumP51885 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LumP51885 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LumP51885 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LumP51885 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LumP51885 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LumP51885 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LumP51885 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LumP51885 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LumP51885 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LumP51885 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LumP51885 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LumP51885 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LumP51885 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LumP51885 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LumP51885 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LumP51885 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LumP51885 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LumP51885 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LumP51885 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LumP51885 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LumP51885 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LumP51885 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LumP51885 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LumP51885 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LumP51885 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LumP51885 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LumP51885 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LumP51885 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LumP51885 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LumP51885 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LumP51885 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LumP51885 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LumP51885 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LumP51885 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LumP51885 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LumP51885 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LumP51885 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LumP51885 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LumP51885 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LumP51885 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LumP51885 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LumP51885 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LumP51885 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LumP51885 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LumP51885 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LumP51885 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LumP51885 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LumP51885 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LumP51885 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LumP51885 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LumP51885 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LumP51885 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LumP51885 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LumP51885 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LumP51885 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LumP51885 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LumP51885 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LumP51885 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LumP51885 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LumP51885 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LumP51885 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LumP51885 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LumP51885 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LumP51885 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms