Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gdi1P50396 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gdi1P50396 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdi1P50396 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdi1P50396 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms