Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VegfbP49766 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VegfbP49766 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VegfbP49766 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VegfbP49766 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VegfbP49766 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VegfbP49766 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VegfbP49766 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VegfbP49766 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VegfbP49766 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VegfbP49766 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VegfbP49766 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VegfbP49766 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VegfbP49766 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VegfbP49766 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
VegfbP49766 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VegfbP49766 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VegfbP49766 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms