Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx2P48379 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx2P48379 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rfx2P48379 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfx2P48379 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rfx2P48379 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rfx2P48379 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx2P48379 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms