Protein–RNA interactions for Protein: P47879

Igfbp4, Insulin-like growth factor-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp4P47879 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Igfbp4P47879 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Igfbp4P47879 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Igfbp4P47879 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Igfbp4P47879 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Igfbp4P47879 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Igfbp4P47879 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Igfbp4P47879 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Igfbp4P47879 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Igfbp4P47879 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Igfbp4P47879 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms