Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfkmP47857 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PfkmP47857 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfkmP47857 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PfkmP47857 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PfkmP47857 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfkmP47857 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PfkmP47857 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PfkmP47857 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PfkmP47857 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PfkmP47857 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PfkmP47857 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PfkmP47857 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms