Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdf7P43029 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdf7P43029 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf7P43029 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gdf7P43029 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf7P43029 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gdf7P43029 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf7P43029 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf7P43029 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms