Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik2P39087 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik2P39087 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik2P39087 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik2P39087 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik2P39087 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik2P39087 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik2P39087 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik2P39087 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grik2P39087 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik2P39087 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik2P39087 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik2P39087 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms