Protein–RNA interactions for Protein: P36368

Egfbp2, Epidermal growth factor-binding protein type B, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egfbp2P36368 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Egfbp2P36368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Egfbp2P36368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Egfbp2P36368 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Egfbp2P36368 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egfbp2P36368 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egfbp2P36368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms