Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hoxc10P31257 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Hoxc10P31257 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxc10P31257 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxc10P31257 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxc10P31257 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxc10P31257 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxc10P31257 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms