Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vcam1P29533 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Vcam1P29533 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vcam1P29533 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vcam1P29533 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vcam1P29533 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vcam1P29533 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Vcam1P29533 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vcam1P29533 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vcam1P29533 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Vcam1P29533 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vcam1P29533 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Vcam1P29533 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vcam1P29533 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vcam1P29533 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vcam1P29533 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vcam1P29533 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms