Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epha3P29319 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Epha3P29319 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epha3P29319 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epha3P29319 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Epha3P29319 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epha3P29319 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epha3P29319 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epha3P29319 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Epha3P29319 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha3P29319 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha3P29319 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha3P29319 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Epha3P29319 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha3P29319 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Epha3P29319 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Epha3P29319 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Epha3P29319 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms