Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RxrgP28705 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RxrgP28705 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxrgP28705 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RxrgP28705 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RxrgP28705 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RxrgP28705 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RxrgP28705 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RxrgP28705 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RxrgP28705 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxrgP28705 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RxrgP28705 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxrgP28705 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxrgP28705 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RxrgP28705 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms