Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,7■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16,69■□□□□ 0,26
Defa3P28310 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,68■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,68■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,67■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16,66■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Defa3P28310 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa3P28310 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa3P28310 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16,63■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16,62■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,61■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,6■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,59■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,25
Defa3P28310 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,58■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16,57■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,56■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,55■□□□□ 0,24
Defa3P28310 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,54■□□□□ 0,24
Defa3P28310 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16,53■□□□□ 0,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms