Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2afxP27661 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afxP27661 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2afxP27661 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afxP27661 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afxP27661 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2afxP27661 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2afxP27661 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H2afxP27661 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H2afxP27661 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2afxP27661 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2afxP27661 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 537.4 ms