Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CftrP26361 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CftrP26361 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CftrP26361 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CftrP26361 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CftrP26361 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CftrP26361 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CftrP26361 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CftrP26361 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
CftrP26361 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CftrP26361 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CftrP26361 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
CftrP26361 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
CftrP26361 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CftrP26361 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CftrP26361 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CftrP26361 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CftrP26361 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
CftrP26361 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CftrP26361 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CftrP26361 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
CftrP26361 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CftrP26361 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CftrP26361 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CftrP26361 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CftrP26361 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CftrP26361 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CftrP26361 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CftrP26361 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CftrP26361 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CftrP26361 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CftrP26361 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CftrP26361 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CftrP26361 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CftrP26361 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
CftrP26361 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
CftrP26361 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CftrP26361 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CftrP26361 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CftrP26361 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CftrP26361 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CftrP26361 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CftrP26361 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CftrP26361 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CftrP26361 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CftrP26361 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CftrP26361 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CftrP26361 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CftrP26361 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CftrP26361 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
CftrP26361 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CftrP26361 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
CftrP26361 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CftrP26361 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CftrP26361 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CftrP26361 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CftrP26361 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CftrP26361 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.23
CftrP26361 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CftrP26361 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CftrP26361 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CftrP26361 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CftrP26361 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CftrP26361 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CftrP26361 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CftrP26361 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CftrP26361 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CftrP26361 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CftrP26361 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CftrP26361 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CftrP26361 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CftrP26361 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CftrP26361 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CftrP26361 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CftrP26361 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CftrP26361 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CftrP26361 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CftrP26361 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CftrP26361 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CftrP26361 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CftrP26361 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CftrP26361 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CftrP26361 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CftrP26361 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CftrP26361 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CftrP26361 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CftrP26361 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CftrP26361 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CftrP26361 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CftrP26361 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CftrP26361 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CftrP26361 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CftrP26361 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CftrP26361 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CftrP26361 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms