Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RarbP22605 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RarbP22605 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RarbP22605 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RarbP22605 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RarbP22605 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RarbP22605 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RarbP22605 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RarbP22605 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RarbP22605 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RarbP22605 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RarbP22605 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RarbP22605 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RarbP22605 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RarbP22605 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RarbP22605 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RarbP22605 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RarbP22605 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RarbP22605 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RarbP22605 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RarbP22605 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RarbP22605 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RarbP22605 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RarbP22605 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RarbP22605 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RarbP22605 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RarbP22605 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RarbP22605 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RarbP22605 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RarbP22605 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RarbP22605 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RarbP22605 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RarbP22605 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RarbP22605 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RarbP22605 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RarbP22605 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RarbP22605 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RarbP22605 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RarbP22605 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RarbP22605 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RarbP22605 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RarbP22605 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RarbP22605 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RarbP22605 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RarbP22605 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RarbP22605 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RarbP22605 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RarbP22605 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RarbP22605 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RarbP22605 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RarbP22605 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RarbP22605 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RarbP22605 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RarbP22605 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RarbP22605 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RarbP22605 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RarbP22605 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RarbP22605 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RarbP22605 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RarbP22605 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RarbP22605 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RarbP22605 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RarbP22605 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RarbP22605 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RarbP22605 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RarbP22605 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RarbP22605 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RarbP22605 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RarbP22605 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RarbP22605 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RarbP22605 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RarbP22605 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RarbP22605 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms