Protein–RNA interactions for Protein: P16381

D1Pas1, Putative ATP-dependent RNA helicase Pl10, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D1Pas1P16381 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D1Pas1P16381 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
D1Pas1P16381 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
D1Pas1P16381 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
D1Pas1P16381 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
D1Pas1P16381 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
D1Pas1P16381 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
D1Pas1P16381 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
D1Pas1P16381 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
D1Pas1P16381 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
D1Pas1P16381 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
D1Pas1P16381 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
D1Pas1P16381 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.4 ms