Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd44P15379 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd44P15379 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd44P15379 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd44P15379 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd44P15379 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd44P15379 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd44P15379 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd44P15379 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd44P15379 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd44P15379 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd44P15379 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd44P15379 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd44P15379 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd44P15379 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd44P15379 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd44P15379 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd44P15379 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd44P15379 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd44P15379 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cd44P15379 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms