Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myf6P15375 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myf6P15375 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf6P15375 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf6P15375 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf6P15375 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf6P15375 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myf6P15375 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf6P15375 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Myf6P15375 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Myf6P15375 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Myf6P15375 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms