Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Tnp1P10856 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Tnp1P10856 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tnp1P10856 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms