Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb3P09026 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxb3P09026 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxb3P09026 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxb3P09026 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxb3P09026 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxb3P09026 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxb3P09026 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms