Protein–RNA interactions for Protein: P02089

Hbb-b2, Hemoglobin subunit beta-2, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-b2P02089 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-b2P02089 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hbb-b2P02089 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-b2P02089 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hbb-b2P02089 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hbb-b2P02089 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.8 ms