Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd160O88875 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd160O88875 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd160O88875 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cd160O88875 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd160O88875 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd160O88875 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd160O88875 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd160O88875 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd160O88875 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd160O88875 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd160O88875 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd160O88875 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd160O88875 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd160O88875 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd160O88875 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd160O88875 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd160O88875 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd160O88875 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd160O88875 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms