Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp9O88851 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp9O88851 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp9O88851 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp9O88851 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms