Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp2O88554 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Parp2O88554 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Parp2O88554 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Parp2O88554 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Parp2O88554 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Parp2O88554 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Parp2O88554 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Parp2O88554 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Parp2O88554 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Parp2O88554 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Parp2O88554 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Parp2O88554 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms