Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt3bO88509 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnmt3bO88509 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnmt3bO88509 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dnmt3bO88509 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3bO88509 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms