Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mid1O70583 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mid1O70583 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid1O70583 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid1O70583 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mid1O70583 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mid1O70583 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mid1O70583 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1O70583 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mid1O70583 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mid1O70583 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mid1O70583 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid1O70583 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mid1O70583 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mid1O70583 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mid1O70583 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1O70583 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mid1O70583 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mid1O70583 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mid1O70583 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms