Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl35aO55142 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl35aO55142 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl35aO55142 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl35aO55142 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl35aO55142 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms