Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FxnO35943 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FxnO35943 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FxnO35943 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FxnO35943 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FxnO35943 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FxnO35943 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FxnO35943 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FxnO35943 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FxnO35943 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FxnO35943 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FxnO35943 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FxnO35943 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FxnO35943 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FxnO35943 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FxnO35943 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FxnO35943 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FxnO35943 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FxnO35943 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FxnO35943 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FxnO35943 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FxnO35943 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FxnO35943 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FxnO35943 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FxnO35943 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FxnO35943 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FxnO35943 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FxnO35943 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FxnO35943 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FxnO35943 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FxnO35943 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FxnO35943 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FxnO35943 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FxnO35943 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FxnO35943 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FxnO35943 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FxnO35943 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FxnO35943 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FxnO35943 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FxnO35943 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FxnO35943 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FxnO35943 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FxnO35943 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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FxnO35943 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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FxnO35943 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FxnO35943 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FxnO35943 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FxnO35943 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FxnO35943 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FxnO35943 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FxnO35943 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FxnO35943 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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FxnO35943 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FxnO35943 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FxnO35943 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FxnO35943 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FxnO35943 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FxnO35943 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FxnO35943 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FxnO35943 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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FxnO35943 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FxnO35943 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FxnO35943 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FxnO35943 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FxnO35943 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FxnO35943 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FxnO35943 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FxnO35943 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FxnO35943 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FxnO35943 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FxnO35943 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FxnO35943 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FxnO35943 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FxnO35943 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FxnO35943 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FxnO35943 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FxnO35943 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FxnO35943 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FxnO35943 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FxnO35943 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms