Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PnnO35691 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PnnO35691 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PnnO35691 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PnnO35691 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PnnO35691 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PnnO35691 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PnnO35691 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PnnO35691 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PnnO35691 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PnnO35691 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PnnO35691 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PnnO35691 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PnnO35691 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PnnO35691 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PnnO35691 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PnnO35691 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PnnO35691 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PnnO35691 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PnnO35691 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PnnO35691 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PnnO35691 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PnnO35691 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PnnO35691 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PnnO35691 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PnnO35691 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PnnO35691 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PnnO35691 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PnnO35691 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PnnO35691 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PnnO35691 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PnnO35691 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PnnO35691 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PnnO35691 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PnnO35691 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PnnO35691 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PnnO35691 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PnnO35691 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PnnO35691 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PnnO35691 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PnnO35691 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PnnO35691 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PnnO35691 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PnnO35691 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PnnO35691 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PnnO35691 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PnnO35691 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PnnO35691 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PnnO35691 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PnnO35691 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PnnO35691 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PnnO35691 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PnnO35691 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PnnO35691 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PnnO35691 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PnnO35691 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PnnO35691 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PnnO35691 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PnnO35691 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PnnO35691 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PnnO35691 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PnnO35691 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PnnO35691 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PnnO35691 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PnnO35691 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PnnO35691 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PnnO35691 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PnnO35691 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PnnO35691 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PnnO35691 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PnnO35691 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PnnO35691 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PnnO35691 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PnnO35691 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PnnO35691 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PnnO35691 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PnnO35691 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PnnO35691 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PnnO35691 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PnnO35691 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PnnO35691 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PnnO35691 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PnnO35691 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PnnO35691 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PnnO35691 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PnnO35691 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PnnO35691 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PnnO35691 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PnnO35691 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms