Protein–RNA interactions for Protein: O35627

Nr1i3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i3O35627 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nr1i3O35627 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nr1i3O35627 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1i3O35627 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1i3O35627 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr1i3O35627 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1i3O35627 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1i3O35627 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms