Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Npc1O35604 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Npc1O35604 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Npc1O35604 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npc1O35604 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npc1O35604 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npc1O35604 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npc1O35604 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npc1O35604 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npc1O35604 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Npc1O35604 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npc1O35604 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1O35604 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1O35604 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npc1O35604 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1O35604 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npc1O35604 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1O35604 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Npc1O35604 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Npc1O35604 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms