Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaxO35602 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaxO35602 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaxO35602 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RaxO35602 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaxO35602 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaxO35602 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaxO35602 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RaxO35602 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RaxO35602 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RaxO35602 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RaxO35602 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RaxO35602 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RaxO35602 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RaxO35602 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RaxO35602 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RaxO35602 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RaxO35602 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RaxO35602 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RaxO35602 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RaxO35602 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RaxO35602 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RaxO35602 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RaxO35602 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaxO35602 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RaxO35602 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaxO35602 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RaxO35602 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RaxO35602 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaxO35602 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RaxO35602 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaxO35602 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaxO35602 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaxO35602 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RaxO35602 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaxO35602 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaxO35602 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaxO35602 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RaxO35602 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaxO35602 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RaxO35602 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaxO35602 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RaxO35602 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RaxO35602 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RaxO35602 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RaxO35602 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RaxO35602 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RaxO35602 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaxO35602 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RaxO35602 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RaxO35602 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaxO35602 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaxO35602 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RaxO35602 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RaxO35602 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaxO35602 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaxO35602 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaxO35602 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RaxO35602 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaxO35602 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaxO35602 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RaxO35602 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RaxO35602 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaxO35602 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaxO35602 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RaxO35602 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RaxO35602 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RaxO35602 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaxO35602 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RaxO35602 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaxO35602 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaxO35602 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RaxO35602 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RaxO35602 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RaxO35602 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaxO35602 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaxO35602 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaxO35602 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RaxO35602 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RaxO35602 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaxO35602 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaxO35602 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RaxO35602 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RaxO35602 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RaxO35602 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RaxO35602 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RaxO35602 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RaxO35602 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaxO35602 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RaxO35602 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms