Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xbp1O35426 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xbp1O35426 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xbp1O35426 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xbp1O35426 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xbp1O35426 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Xbp1O35426 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms