Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hdac1O09106 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hdac1O09106 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac1O09106 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac1O09106 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac1O09106 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hdac1O09106 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac1O09106 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms