Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Snap23O09044 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Snap23O09044 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Snap23O09044 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Snap23O09044 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Snap23O09044 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Snap23O09044 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Snap23O09044 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snap23O09044 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snap23O09044 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Snap23O09044 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snap23O09044 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Snap23O09044 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Snap23O09044 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Snap23O09044 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snap23O09044 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Snap23O09044 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Snap23O09044 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Snap23O09044 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Snap23O09044 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Snap23O09044 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Snap23O09044 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Snap23O09044 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Snap23O09044 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms