Protein–RNA interactions for Protein: O08797

Serpinb9, SPI6, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb9O08797 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb9O08797 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Serpinb9O08797 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Serpinb9O08797 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Serpinb9O08797 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Serpinb9O08797 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Serpinb9O08797 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Serpinb9O08797 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serpinb9O08797 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Serpinb9O08797 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpinb9O08797 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Serpinb9O08797 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms