Protein–RNA interactions for Protein: L7N292

Gm3573, Predicted gene 3573, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3573L7N292 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm3573L7N292 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm3573L7N292 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm3573L7N292 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm3573L7N292 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm3573L7N292 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3573L7N292 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms