Protein–RNA interactions for Protein: K7N6Z8

Vmn2r9, Vomeronasal 2, receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r9K7N6Z8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn2r9K7N6Z8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vmn2r9K7N6Z8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn2r9K7N6Z8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn2r9K7N6Z8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn2r9K7N6Z8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn2r9K7N6Z8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r9K7N6Z8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r9K7N6Z8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn2r9K7N6Z8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn2r9K7N6Z8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms