Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21972J3QN38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm21972J3QN38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm21972J3QN38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms