Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim55G3X8Y1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim55G3X8Y1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim55G3X8Y1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim55G3X8Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms