Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17654F7AXR3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17654F7AXR3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17654F7AXR3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17654F7AXR3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms