Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl17F6R5P4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl17F6R5P4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl17F6R5P4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl17F6R5P4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms