Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Tarbp1E9Q368 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Tarbp1E9Q368 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Tarbp1E9Q368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Tarbp1E9Q368 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Tarbp1E9Q368 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Tarbp1E9Q368 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Tarbp1E9Q368 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Tarbp1E9Q368 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Tarbp1E9Q368 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms