Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sbf2E9PXF8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sbf2E9PXF8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sbf2E9PXF8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sbf2E9PXF8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sbf2E9PXF8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sbf2E9PXF8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sbf2E9PXF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms