Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sfta2E9PXB6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfta2E9PXB6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfta2E9PXB6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms