Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smpd5D6MZJ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd5D6MZJ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd5D6MZJ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd5D6MZJ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd5D6MZJ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd5D6MZJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms