Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms