Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
3425401B19RikD3Z1D3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
3425401B19RikD3Z1D3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
3425401B19RikD3Z1D3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
3425401B19RikD3Z1D3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
3425401B19RikD3Z1D3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
3425401B19RikD3Z1D3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
3425401B19RikD3Z1D3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
3425401B19RikD3Z1D3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
3425401B19RikD3Z1D3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
3425401B19RikD3Z1D3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
3425401B19RikD3Z1D3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
3425401B19RikD3Z1D3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms